MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	TAA	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017725	TA	3	6	756	761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017725	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017725	TAA	2	6	771	776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017725	A	6	6	823	828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017725	T	6	6	2213	2218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017725	A	7	7	2227	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017725	A	6	6	2246	2251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017725	TA	3	6	2258	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017725	AAAT	2	8	2360	2367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017725	A	6	6	2396	2401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017725	CT	3	6	2419	2424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017725	TCC	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017725	A	6	6	3810	3815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017725	TAAT	2	8	3829	3836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017725	AT	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017725	AATT	2	8	3841	3848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017725	ATTA	2	8	3851	3858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017725	AT	4	8	3875	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017725	TAAAA	2	10	3884	3893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017725	TTAT	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017725	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017725	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017725	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017725	AT	3	6	3936	3941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017725	ATTA	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017725	TAAA	2	8	3966	3973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017725	A	7	7	5781	5787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017725	ATTA	2	8	6453	6460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017725	TAA	2	6	6492	6497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017725	ATT	2	6	6518	6523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017725	TA	3	6	6540	6545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017725	ACTTT	2	10	7647	7656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017725	T	7	7	7654	7660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017725	TAT	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017725	AAC	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017725	TAA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017725	ATTA	2	8	7952	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017725	A	6	6	7982	7987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017725	TACT	2	8	8000	8007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017725	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017725	TAA	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017725	A	9	9	8523	8531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017725	A	6	6	8570	8575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017725	TATTG	2	10	8579	8588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017725	TAA	2	6	8599	8604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017725	A	7	7	8603	8609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017725	A	6	6	8626	8631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017725	A	8	8	8667	8674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017725	T	7	7	8675	8681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017725	ATT	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017725	ATA	2	6	8736	8741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017725	AAT	2	6	8742	8747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017725	A	6	6	8808	8813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017725	CAA	2	6	8836	8841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017725	T	6	6	8866	8871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017725	TAT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017725	A	8	8	8945	8952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017725	TA	3	6	8958	8963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017725	A	6	6	8976	8981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017725	AAG	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017725	TAAAAA	3	18	9023	9040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017725	AG	3	6	9065	9070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017725	A	6	6	9111	9116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017725	AGT	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017725	AAT	2	6	9339	9344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017725	AT	4	8	9343	9350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017725	A	6	6	9360	9365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017725	TAAA	2	8	9397	9404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017725	GAA	2	6	9450	9455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017725	T	7	7	9487	9493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017725	A	6	6	10550	10555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017725	A	7	7	10575	10581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017725	TA	3	6	10590	10595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017725	TA	3	6	10602	10607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017725	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017725	AAT	2	6	10646	10651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017725	ATT	2	6	10691	10696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017725	TA	3	6	10708	10713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017725	TA	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017725	T	8	8	10726	10733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017725	A	6	6	10763	10768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017725	A	7	7	11293	11299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017725	ATA	3	9	11316	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017725	T	6	6	11327	11332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017725	AAT	2	6	11347	11352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017725	TAA	2	6	11356	11361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017725	ATTA	2	8	11362	11369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017725	T	8	8	11386	11393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017725	A	6	6	11395	11400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017725	A	6	6	11407	11412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017725	CTAT	2	8	11593	11600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017725	TAG	2	6	11605	11610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017725	T	6	6	11631	11636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017725	A	7	7	11637	11643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017725	AAT	2	6	11654	11659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017725	AT	3	6	11713	11718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017725	TTAA	2	8	11719	11726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017725	ATT	2	6	11788	11793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017725	AATA	2	8	11797	11804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017725	ATT	2	6	11829	11834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017725	CTTA	2	8	11844	11851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017725	ATTTA	2	10	11988	11997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017725	T	6	6	12019	12024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017725	A	6	6	12053	12058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017725	ATCTA	2	10	12076	12085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017725	TAAA	2	8	12086	12093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017725	TAT	2	6	12114	12119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017725	TTAT	3	12	12116	12127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017725	AAT	2	6	12128	12133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017725	T	7	7	12187	12193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017725	ATT	2	6	12239	12244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017725	AAAG	2	8	12257	12264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017725	TTTAG	2	10	12289	12298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017725	AAT	2	6	12315	12320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017725	TCAAAA	2	12	12343	12354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017725	T	8	8	12366	12373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017725	AAG	2	6	12379	12384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017725	AAT	2	6	12427	12432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017725	AT	3	6	12454	12459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017725	AAATTT	2	12	12475	12486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017725	TTTAT	2	10	14112	14121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017725	T	7	7	14121	14127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017725	AAAAT	2	10	14131	14140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017725	TAAAA	2	10	14209	14218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017725	TTA	2	6	14228	14233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017725	ATT	2	6	14239	14244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017725	TTA	2	6	14251	14256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017725	ATT	2	6	14320	14325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017725	ATT	2	6	14335	14340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017725	CCT	2	6	14343	14348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017725	GTT	2	6	14355	14360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017725	A	6	6	14369	14374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017725	TAC	2	6	14969	14974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017725	CTT	2	6	15032	15037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017725	TAT	2	6	15105	15110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017725	CAG	2	6	15209	15214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017725	CTA	2	6	15229	15234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017725	TGCA	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017725	TCT	2	6	15262	15267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017725	TTC	2	6	15297	15302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017725	TGT	2	6	15307	15312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017725	GTT	2	6	15331	15336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017725	T	6	6	15368	15373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017725	TTA	2	6	17242	17247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017725	GTTT	2	8	17315	17322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017725	AAT	2	6	17335	17340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017725	AAT	2	6	17346	17351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017725	AAT	2	6	17357	17362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017725	ATT	2	6	17386	17391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017725	ATT	2	6	17397	17402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017725	T	8	8	17401	17408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017725	A	6	6	17413	17418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017725	GAAAA	2	10	17421	17430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017725	TTG	2	6	17432	17437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017725	T	6	6	18493	18498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_017725	T	8	8	18540	18547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.